有商品先行放行辦法所列高風險之情形者，如曾有不合格/不符合紀錄、曾違反先行放行運出貨物儲存地點或封存相關規定、先行放行商品未依指定時間完成相關作業、商品有衛生安全疑慮等，均不得准予先行放行（詳如商品先行放行辦法第5條規定）。

另同一報驗義務人之同種類商品，若以「型式認可逐批檢驗商品未取得型式認可」、「已申請未取得驗證登錄」等事由申請先行放行，分別僅以核准一次為限。